Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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