Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATMQ13315 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATMQ13315 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATMQ13315 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATMQ13315 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATMQ13315 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATMQ13315 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATMQ13315 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATMQ13315 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATMQ13315 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATMQ13315 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATMQ13315 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATMQ13315 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATMQ13315 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATMQ13315 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATMQ13315 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATMQ13315 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATMQ13315 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATMQ13315 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATMQ13315 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATMQ13315 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATMQ13315 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATMQ13315 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATMQ13315 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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