Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TROQ12816 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TROQ12816 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TROQ12816 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TROQ12816 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TROQ12816 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TROQ12816 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TROQ12816 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TROQ12816 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TROQ12816 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TROQ12816 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TROQ12816 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TROQ12816 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TROQ12816 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TROQ12816 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TROQ12816 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TROQ12816 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TROQ12816 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TROQ12816 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TROQ12816 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TROQ12816 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TROQ12816 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TROQ12816 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TROQ12816 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TROQ12816 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TROQ12816 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TROQ12816 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TROQ12816 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TROQ12816 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TROQ12816 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TROQ12816 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TROQ12816 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TROQ12816 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TROQ12816 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TROQ12816 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TROQ12816 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TROQ12816 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TROQ12816 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TROQ12816 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TROQ12816 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TROQ12816 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TROQ12816 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TROQ12816 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TROQ12816 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TROQ12816 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TROQ12816 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TROQ12816 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TROQ12816 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TROQ12816 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TROQ12816 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TROQ12816 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TROQ12816 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TROQ12816 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TROQ12816 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TROQ12816 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TROQ12816 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TROQ12816 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TROQ12816 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TROQ12816 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TROQ12816 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TROQ12816 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TROQ12816 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TROQ12816 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TROQ12816 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TROQ12816 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TROQ12816 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TROQ12816 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TROQ12816 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TROQ12816 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TROQ12816 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TROQ12816 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TROQ12816 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TROQ12816 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TROQ12816 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TROQ12816 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TROQ12816 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TROQ12816 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TROQ12816 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TROQ12816 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TROQ12816 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TROQ12816 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TROQ12816 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TROQ12816 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TROQ12816 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TROQ12816 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TROQ12816 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TROQ12816 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TROQ12816 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROQ12816 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROQ12816 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROQ12816 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROQ12816 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROQ12816 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROQ12816 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROQ12816 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROQ12816 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TROQ12816 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TROQ12816 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROQ12816 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROQ12816 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms