Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms