Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms