Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FMODQ06828 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FMODQ06828 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FMODQ06828 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FMODQ06828 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FMODQ06828 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FMODQ06828 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FMODQ06828 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FMODQ06828 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FMODQ06828 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FMODQ06828 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FMODQ06828 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FMODQ06828 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FMODQ06828 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FMODQ06828 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms