Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms