Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms