Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms