Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMF1P82094 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMF1P82094 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMF1P82094 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMF1P82094 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMF1P82094 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMF1P82094 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMF1P82094 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMF1P82094 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMF1P82094 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMF1P82094 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMF1P82094 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMF1P82094 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMF1P82094 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMF1P82094 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMF1P82094 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMF1P82094 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMF1P82094 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMF1P82094 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMF1P82094 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMF1P82094 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMF1P82094 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMF1P82094 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMF1P82094 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMF1P82094 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMF1P82094 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMF1P82094 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMF1P82094 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMF1P82094 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMF1P82094 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms