Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX1P78337 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX1P78337 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX1P78337 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX1P78337 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX1P78337 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX1P78337 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX1P78337 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX1P78337 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX1P78337 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX1P78337 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX1P78337 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX1P78337 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX1P78337 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX1P78337 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX1P78337 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX1P78337 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms