Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms