Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFM1P61960 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFM1P61960 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms