Protein–RNA interactions for Protein: P61129

ZC3H6, Zinc finger CCCH domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H6P61129 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZC3H6P61129 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H6P61129 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H6P61129 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H6P61129 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H6P61129 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H6P61129 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H6P61129 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZC3H6P61129 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms