Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIK1P57059 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIK1P57059 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIK1P57059 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIK1P57059 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIK1P57059 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIK1P57059 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIK1P57059 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SIK1P57059 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIK1P57059 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIK1P57059 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIK1P57059 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIK1P57059 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SIK1P57059 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SIK1P57059 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIK1P57059 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIK1P57059 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIK1P57059 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SIK1P57059 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIK1P57059 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIK1P57059 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIK1P57059 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIK1P57059 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIK1P57059 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIK1P57059 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIK1P57059 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIK1P57059 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIK1P57059 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIK1P57059 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIK1P57059 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIK1P57059 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIK1P57059 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIK1P57059 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIK1P57059 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIK1P57059 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIK1P57059 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SIK1P57059 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIK1P57059 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIK1P57059 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIK1P57059 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIK1P57059 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIK1P57059 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIK1P57059 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIK1P57059 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIK1P57059 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIK1P57059 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIK1P57059 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIK1P57059 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIK1P57059 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIK1P57059 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIK1P57059 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIK1P57059 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIK1P57059 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIK1P57059 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIK1P57059 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIK1P57059 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIK1P57059 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIK1P57059 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIK1P57059 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIK1P57059 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIK1P57059 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIK1P57059 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIK1P57059 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIK1P57059 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIK1P57059 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIK1P57059 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIK1P57059 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIK1P57059 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SIK1P57059 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIK1P57059 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIK1P57059 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIK1P57059 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIK1P57059 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIK1P57059 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIK1P57059 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIK1P57059 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms