Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms