Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MVDP53602 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MVDP53602 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms