Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms