Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTPAP49638 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTPAP49638 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTPAP49638 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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