Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC4A3P48751 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC4A3P48751 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC4A3P48751 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC4A3P48751 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC4A3P48751 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC4A3P48751 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC4A3P48751 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC4A3P48751 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC4A3P48751 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A3P48751 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A3P48751 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A3P48751 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A3P48751 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A3P48751 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A3P48751 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A3P48751 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A3P48751 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A3P48751 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A3P48751 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A3P48751 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A3P48751 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A3P48751 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A3P48751 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A3P48751 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A3P48751 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A3P48751 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A3P48751 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A3P48751 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A3P48751 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms