Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms