Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CASP3P42574 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CASP3P42574 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CASP3P42574 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP3P42574 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP3P42574 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP3P42574 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms