Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPOP42166 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPOP42166 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPOP42166 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPOP42166 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPOP42166 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPOP42166 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPOP42166 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPOP42166 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPOP42166 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPOP42166 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPOP42166 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPOP42166 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPOP42166 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPOP42166 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPOP42166 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPOP42166 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPOP42166 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPOP42166 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPOP42166 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPOP42166 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPOP42166 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPOP42166 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPOP42166 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPOP42166 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPOP42166 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPOP42166 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPOP42166 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPOP42166 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPOP42166 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPOP42166 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPOP42166 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPOP42166 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPOP42166 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPOP42166 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPOP42166 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMPOP42166 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMPOP42166 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMPOP42166 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMPOP42166 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMPOP42166 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMPOP42166 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMPOP42166 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms