Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBRP36941 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBRP36941 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LTBRP36941 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LTBRP36941 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LTBRP36941 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LTBRP36941 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LTBRP36941 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LTBRP36941 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LTBRP36941 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
LTBRP36941 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LTBRP36941 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms