Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms