Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSPOP30536 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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