Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms