Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SERPINB3P29508 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERPINB3P29508 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERPINB3P29508 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERPINB3P29508 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERPINB3P29508 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERPINB3P29508 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERPINB3P29508 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERPINB3P29508 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERPINB3P29508 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERPINB3P29508 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERPINB3P29508 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERPINB3P29508 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERPINB3P29508 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERPINB3P29508 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERPINB3P29508 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERPINB3P29508 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERPINB3P29508 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERPINB3P29508 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERPINB3P29508 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERPINB3P29508 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms