Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHC1P29353 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHC1P29353 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SHC1P29353 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHC1P29353 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms