Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLD1P28340 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLD1P28340 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
POLD1P28340 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
POLD1P28340 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
POLD1P28340 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLD1P28340 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLD1P28340 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLD1P28340 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLD1P28340 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLD1P28340 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLD1P28340 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLD1P28340 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLD1P28340 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLD1P28340 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLD1P28340 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLD1P28340 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLD1P28340 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLD1P28340 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLD1P28340 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLD1P28340 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLD1P28340 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLD1P28340 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLD1P28340 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLD1P28340 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLD1P28340 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLD1P28340 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLD1P28340 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms