Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms