Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTX3P26022 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTX3P26022 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTX3P26022 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTX3P26022 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTX3P26022 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTX3P26022 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTX3P26022 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTX3P26022 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTX3P26022 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTX3P26022 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms