Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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