Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms