Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms