Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPN3P20807 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPN3P20807 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPN3P20807 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPN3P20807 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPN3P20807 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPN3P20807 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPN3P20807 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPN3P20807 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPN3P20807 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPN3P20807 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPN3P20807 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPN3P20807 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPN3P20807 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPN3P20807 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPN3P20807 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPN3P20807 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms