Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
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PTPRAP18433 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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PTPRAP18433 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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PTPRAP18433 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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PTPRAP18433 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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