Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms