Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GLI4P10075 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GLI4P10075 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GLI4P10075 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GLI4P10075 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GLI4P10075 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GLI4P10075 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI4P10075 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI4P10075 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI4P10075 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI4P10075 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI4P10075 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI4P10075 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI4P10075 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI4P10075 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI4P10075 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI4P10075 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI4P10075 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms