Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPRP00739 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPRP00739 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPRP00739 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPRP00739 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPRP00739 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPRP00739 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPRP00739 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPRP00739 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms