Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVILO95425 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVILO95425 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVILO95425 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVILO95425 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVILO95425 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVILO95425 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVILO95425 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVILO95425 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVILO95425 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVILO95425 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVILO95425 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SVILO95425 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVILO95425 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVILO95425 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVILO95425 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVILO95425 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVILO95425 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVILO95425 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVILO95425 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVILO95425 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms