Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOL3O95236 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOL3O95236 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOL3O95236 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOL3O95236 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOL3O95236 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOL3O95236 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOL3O95236 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
APOL3O95236 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOL3O95236 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms