Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA10O75578 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA10O75578 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms