Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms