Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms