Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD28O15084 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms