Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms