Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms