Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms