Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms